在一个科技与魔法交织的世界，国立魔法大学附属第一高校的门槛前，迎来了两位不同寻常的新生。哥哥达也，一个在魔法领域饱受诟病的劣等生；妹妹深雪，则是光芒四射、几乎完美的优等生。尽管被命运赋予了截然不同的标签，兄妹俩在充满挑战与未知的校园生活中，共同经历了一系列惊心动魄的事件。

从政治结社《布兰什》的突袭，到香港系国际犯罪集团《无头龙》对九校战的干预；从大亚联盟军对横滨的侵攻，到魔物寄生者帕拉斯特的恐怖威胁；再到USNA军魔法师部队总队长安吉?西里乌斯的不速之访，兄妹俩在一次次危机中成长。

随着一年的波折结束，步入二年级的他们生活逐渐发生变化。四叶家派遣的樱井水波与达也等人同住，而达也本人则转入了新设立的魔法工学科，简称《魔工科》。在新的学年里，他们将面对更多的挑战和机遇，探索未知的魔法世界。