在一个魔法与科学并存的未来世界里，魔法不再是神话传说中的虚构力量，而是与科学、超能力相融合，成为人类社会中不可或缺的一部分。国家为了更好地利用这一力量，建立了魔法大学附属第一高校，旨在培养能够为国家效力的魔法人才。 司波达也和妹妹司波深雪是这所高校的新学生，深雪凭借卓越的魔法才能被誉为“花冠”，而哥哥达也则因资质平平，只能作为替补的二科生“杂草”入学。在学校里，他们遇到了性格各异的同学：大大咧咧的千叶艾丽卡、文静胆小的柴田美月、正直勇敢的西城雷欧哈鲁特和认真努力的吉田干比古。 在学习魔法的过程中，达也逐渐展现出不同于常人的能力，不仅在实战中屡建奇功，更揭示了隐藏在学校深处的秘密。他与妹妹深雪及同伴们一起，面对各种挑战，逐渐成长为真正的英雄。然而，在这个过程中，他们也将面临更加严峻的考验和危机。 《魔法科高校的劣等生》不仅是一部关于成长的故事，还探讨了天赋、努力以及团队合作的重要性。在魔法与科学交织的世界里，每个人都有可能成为改变未来的英雄。