在一个充满神话色彩的世界里，来自不同神话体系的神明们聚集于此，共同面对一个紧迫的问题——‘问题儿’的存在，他们对人类持有负面情绪，威胁着人神之间的和谐。为了解决这一危机，众神决定采取一项大胆的计划：建立一所特殊的学校，让一位普通的人类少女草薙结衣担任教师，向这些神明们传授人类的情感与爱。

结衣，一个普通的高中女生，被选中执行这项重要任务。她不仅需要教会神明们理解人类的情感，还要引导他们学会爱与被爱。在这个过程中，结衣与神明之间的关系逐渐升温，产生了一系列令人意想不到的浪漫故事。

随着剧情的发展，结衣发现每个神明背后都有着不为人知的故事和秘密，而她与神明们的互动也渐渐改变了彼此的命运。从最初的困惑与挑战，到逐渐建立起深厚的羁绊，结衣和众神之间的关系变得复杂而微妙。在这个充满魔法与奇迹的世界里，一段段禁断之恋悄然绽放，揭示了爱的真谛。

《众神的恶作剧》不仅是一部关于爱情的故事，更是一次对人性、情感与信仰的深刻探索。